Српска црква у Пећинцима подизана је четири пута у XVIII веку, у доба аустријске царевине и митрополије сремско карловачке, сваки пут посвећена Светом оцу Николају:
– 1720. године, од плетера, са два прозора, покривена трском и без звона.
– 1734. године, од балвана и плетера, са кровом од рогозине, када су у месту пописана 23 дома.
– 1766. године, са темељом од цигле, зидовима од плетера и блата, покривена даском.
– 1770 – 1775. године, зидана од камена и цигле, са звоником дограђеним 1808 – 1810.
Прва два храма налазила су се у „Старом селу“, 1 км југоисточно од данашњег центра, у њима је служио свештеник Мирко Атанацковић, рођен у Пећинцима. Иконостас из 1734. године имао је 11 икона и представља рад непознатог зографа. Нови иконостас и зидне иконе осликао је 1838 – 1843. године Павле Чортановић. Трећи иконостас по реду дело је Николе Ивковића из 1934, Душана Стевановића и Милоша Остојића из 2012-2013. године. У Пећинцима је 1785. године заведена српска школа са учитељем Васиљем Витковићем, у згради која је била у власништву Црквене општине. Свештеник Радомир Павковић и граничар Стефан Коцољевац су 1848. године путовали на Мајску скупштину у Сремским Карловцима. На прозоре храма је 1839. уграђено стакло, а на звонику је 1901. године постављен црквени сат. Прота Љубомир Суботић одведен је 1914. године у логор.
Црквена звона одузела је аустријска војска у Великом рату, а нова, произведена у Италији, постављена су 1923. године. Црквени звоник је порушен на Св. Николу 19.
децембра 1943. године и црква је тешко оштећена. Обнови светог храма приступило се 1960. године и она траје све до данас, трудом свештеника, парохијана и Општине Пећинци.Током три последња века, 1720 – 2020. године, у храму је Богу и народу служило 36 свештеника.
Храмовна слава прославља се сваке године 22. маја.
Од 2019. године Пећинци су седиште Намесништва пећиначког са 15 црквених општина.
КАПЕЛА СВЕТИХ ЖЕНА МИРОНОСИЦА
Саграђена је 2010. године за потребе верника као гробљанска капела, према пројекту дипл. инж. архитектуре Јелене Масникосић из Пећинаца. Изградња је финансирана средствима Општине Пећинци. Мањи иконостас са две иконе сликане у византијском стилу, постављен је 26. августа 2011. године и дело је академског сликара Милоша Остојића из Шида. Капелу је 24. децембра 2010. године свечано освештао епископ сремски Господин Василије.
Капела је посвећена „Светим женама Мироносицама“ које се прослављају друге недеље по Васкрсу.